Вся творческая деятельность профессора А.А. Мамедова посвящена лечению детей с врожденной патологией челюстно-лицевой области. Им прооперировано свыше 4000 детей с данной патологией в возрасте от 0 до 18 и старше лет.
А.А. Мамедов совместно с ведущими стоматологами России основал и был заместителем главного редактора журнала «Детская стоматология». В настоящее время является научным редактором этого же журнала переименованного в «Детская стоматология и профилактика». Является членом редакционного совета 5-х отечественных и двух зарубежных журналов по стоматологии (Азербайджан, Казахстан).
А.А. Мамедов периодически выезжает с докладами, лекциями, консультациями и операциями совместно с местными специалистами в различные регионы России и стран СНГ (Екатеринбург, Волгоград, Южно-Сахалинск, Магадан, Оренбург, Тула, Тверь, Самара, Липецк, Барнаул, Хабаровск, Воронеж, Ташкент, Алматы, Шымкент, Самарканд, Душанбе).
По инициативе профессора Мамедова создан Южно-Сахалинский, Магаданский, Тульский, Липецкий центры реабилитации детей с черепно-челюстно-лицевой патологией, в которых он является научным консультантом. Поддерживает научно-практический потенциал Волгоградского, Оренбургского, Самарского, Алтайского (Барнаул), Тверского Центров диспансеризации детей с врожденной патологией челюстно-лицевой области.
Является академиком Международной академии авторов научных открытий и изобретений (МАНОИ), академиком Международной академии информатизации (МАИ), академиком Российской академии медико-технических наук (РАМТН) и член корреспондентом Российской академии естественных наук (РАЕН), главный внештатный специалист эксперт Федеральной службы по надзору в сфере здравоохранения и социального развития РОСЗДРАВНАДЗОРА.
Сотрудничает с Международным благотворительным фондом «International Cleft Lip and Palate Foundation». Совместно с родителями своих пациентов организовал Российский благотворительный фонд помощи детям «Врожденная расщелина губы и неба» (01 июня 2001) и является его председателем (имеется сайт Фонда), был главным редактором журнала «Врожденная расщелина губы и неба», учрежденным благотворительным фондом. Выступал с докладами на первом (Цюрих-2000), втором (Мюнхен-2002), третьем (Галифакс, Канада, 2004) и четвертом (Итсборн, Англия, 2006) пятом (Даллас, Техас, 2008) Всемирных конгрессах, организатором которых является Международный фонд «Врожденная расщелина губы и неба».
А.А. Мамедов - член Европейской ассоциации черепно-челюстно-лицевых хирургов, входит в Совет Российской ассоциации челюстно-лицевых хирургов, является членом Стоматологической ассоциации России (СтАР), член Российского общества пластических, реконструктивных и эстетических хирургов (РОПРиЭХ).
Член диссертационного и Ученого Совета – ММА имени И.М. Сеченова, Московского государственного медицинского стоматологического университета (МГМСУ). Неоднократно принимал участие в благотворительных акциях, средства с которых пошли на лечение детей с врожденной расщелиной губы и неба.
Ведущий научный сотрудник и руководитель научной группы при кафедре стоматологии детского возраста ММА имени И.М. Сеченова. Ведущий научный сотрудник отделения детской хирургии Научно-исследовательского института педиатрии (НИИпедиатрии) Научного центра здоровья детей Российской академии медицинских наук (НЦЗД РАМН).
Ведет активное сотрудничество с детскими стоматологами России и стран СНГ, проводит совместные научные и практические разработки в области лечения детей с врожденной и наследственной патологией челюстно-лицевой области с учеными и педагогами Баку, Алматы, Шымкента, Ташкента и Душанбе.
Совместно с профессором Л.Е. Фроловой в 1985 году издан «Атлас хирургических способов лечения детей с врожденной расщелиной губы и неба». В 1998 году А.А. Мамедовым издана монография «Врожденная расщелина неба и пути ее устранения», куда вошли как авторские разработки, так и материалы более чем двадцатилетнего опыта работы в клиниках России и стран СНГ, материалы информационно-компьютерной поддержки вышеуказанных проблем. Им создан системный интеллектуальный подсказчик (СИП), компьютерная база данных (база знаний) по этой же проблеме. В настоящее время готовится к изданию руководство по лечению детей с врожденной расщелиной губы и неба, куда уже войдет опыт 36 летней работы с детьми с врожденной челюстно-лицевой патологией.
А.А. Мамедов автор более 300 научных публикаций, в том числе 10 авторских свидетельства на изобретения, 2 положительных решения на выдачу патента, 6 учебно-методических рекомендаций и пособий, материалы информационно-компьютерного решения проблем детской стоматологии. Является автором свыше 90 хирургических разработок по проблеме лечения детей с врожденной расщелиной губы и неба.
В 2008 году присвоена дополнительная квалификация «Преподаватель высшей школы».